Divac y el recién seleccionado en el draft Nick Van Exel lideraron al equipo en la siguiente temporada, pero fue insuficiente. Tras la pérdida de los veteranos Byron Scott y A.C. Green vía agente libre y con Worthy en el crepúsculo de su carrera, el equipo completó una decepcionante campaña con solamente 33 partidos ganados, quedando fuera de los puestos de playoffs por primera vez desde 1976. A finales de la temporada, Pfund fue despedido y Magic Johnson le reemplazó, debutando en los banquillos. Los Lakers firmaron un respetable 33-29 en los primeros 61 partidos sin contar con el lesionado Byron Scott. El capitán Ceballos fue suspendido por el equipo, Van Exel fue castigado con 7 partidos por la NBA por empujar a un árbitro, e incluso Johnson fue expulsado de un partido a finales de temporada por golpear con el hombro al árbitro Scott Foster y fue sancionado con tres partidos de suspensión y una multa de 10 000 dólares. Los californianos ganaron 31 de ellos, en un año repleto de cambios; Van Exel fue traspasado a Denver Nuggets, Del Harris fue reemplazado en el banquillo por Kurt Rambis, el anotador Glen Rice llegó al equipo a cambio de Eddie Jones y Elden Campbell, y el extravagante reboteador Dennis Rodman -ganador de tres campeonatos con los Bulls y dos con los Pistons- fichó por el equipo, pero fue despedido tras disputar solo 23 partidos.

Durante esa serie, el equipo tuvo que jugar un partido como locales en Las Vegas debido a los disturbios de Los Ángeles. En las Finales de la NBA se encontraron con unos sorpresivos Orlando Magic, los cuales habían despachado a los vigentes campeones, Boston Celtics, en las Semifinales de Conferencia, y a Cleveland Cavaliers en las Finales, liderados por el pívot Dwight Howard. Con promedios de 33.0 puntos y 15.8 rebotes por partido, O’Neal fue nombrado de nuevo MVP de las Finales. Estos nuevos «baby-lakers» demostraron un desempeño notable y lograrían un récord de 35-47. Este conjunto despertaba las esperanzas de una afición que llevaba años padeciendo los peores años de la franquicia, sin embargo, 2018 se convertiría en el año en el que todo daría un giro drástico merced a la contratación del mejor jugador de baloncesto de su tiempo: LeBron James. Los Lakers ganaron su primera serie de playoffs en la era post-Magic, batiendo a Seattle SuperSonics en cuatro partidos antes de caer ante San Antonio Spurs por 4-2. Harris fue nombrado Entrenador del Año y Jerry West Mejor Ejecutivo.

Eliminaron a Portland, Sacramento y San Antonio sin perder ningún partido, llegando en un estado de forma magnífico a las Finales de la NBA que le enfrentaban a los Philadelphia 76ers de Allen Iverson. En las finales se encontraron con Boston Celtics 21 años después y jugaron sus primeras finales desde 2004 y la 29.ª en su historia. En el quinto partido, un tiro de Derek Fisher en la bocina para ganar el encuentro salvó la eliminatoria y los Lakers, tras batir a los Timberwolves en las Finales de Conferencia, entraron a las Finales de la NBA. Shaquille O’Neal hizo inútil las dobles y hasta triples defensas que recibió durante el encuentro, anotando 9 puntos en el último cuarto incluyendo un imponente alley-hoop para decidir el encuentro (85-79 con 40 segundos por jugar) y erigirse como decisivo en la remontada final. El quinto partido se caracterizó por el dominio de Paul Pierce, quien hizo inútil la gran actuación de la Mamba Negra -38 puntos- y hacía que los de Massachussetts se adelantaran por primera vez en la eliminatoria. El equipo sorprendió ganando los dos primeros partidos de la primera ronda a Phoenix Suns, incluyendo una actuación de 35 puntos del base Sedale Threatt en el primer encuentro.

A lo largo de la temporada regular se traspasó a Cedric Ceballos a Phoenix Suns a cambio de Robert Horry, doble campeón de la NBA con los Rockets. La savia nueva de un viejo campeón. La temporada 1999-2000 fue el principio de una nueva era en la historia de los Lakers. Los Lakers cayeron en primera ronda de playoffs en manos de Houston Rockets por 3-1, retirándose definitivamente Magic Johnson tras la eliminación. En esa serie, se jugaron los dos últimos partidos de playoffs en el mítico estadio del conjunto de oro y púrpura: el Great Western Forum. Johnson ganó sus cinco primeros partidos, pero cayó en los diez siguientes, siendo la racha de partidos perdidos consecutivos más larga de la historia de la franquicia. Ceballos se convirtió en el primer jugador de la franquicia en 20 años en anotar 50 puntos en un partido. Una de las mejores actuaciones de siempre en el partido decisivo por el título. Robert Kiyosaki recomienda, en primer lugar, desarrollar un negocio tradicional, y posteriormente, las inversiones inmobiliarias (en función del momento económico del país).